logotype
Mecenasi Fundacji Nanonet

Fundacja Wspierania Nanonauk i Nanotechnologii Nanonet jest Organizacją Pożytku Publicznego powołaną do popularyzacji wiedzy o nanotechnologii, inicjowania oraz wspierania działań mających na celu wzmacnianie rozwoju przedsiębiorczości oraz sprzyjania kształtowaniu społeczeństwa informacyjnego.

Nasze portale:

By A Web Design

Nauczanie Modelowania molekularnego a nanotechnologia PDF Drukuj Email
nanoRozwój - Studia i kształcenie
Wpisany przez Marek Doskocz   
sobota, 29 grudnia 2007 23:47

    Chemia, biochemia, inżyniera materiałowa oraz nanotechnologia posługują się już od dłuższego czasu modelowaniem molekularnym (chemią obliczeniową). W dzisiejszych czasach rozwój komputerów oraz programów sprawił, że modelowanie molekularne stało się dostępne dla wszystkich, a obliczenia chemiczne można już przeprowadzać na komputerze osobistym. Koszt oraz czas badań teoretycznych jest niejednokrotnie o wiele mniejszy niż wstępne badania praktyczne, a uzyskane wyniki coraz bardziej zbliżają się do wyników eksperymentalnych.

 

Korzystając z dobrodziejstw chemii teoretycznej możemy dziś z bardzo dobrymi rezultatami obliczać właściwości fizyczne i chemiczne, modelować reakcje oraz stany przejściowe, symulować widma spektroskopowe czy też badać układy bardziej skomplikowane, jakimi są centra aktywne enzymów. Wszechstronnie wykształcony chemik korzysta z najnowszych osiągnięć nauki, jakim niewątpliwie jest także wsparcie badań eksperymentalnych obliczeniami. Dlatego ważną rzeczą jest zapewnienie gruntownego wykształcenia rozumianego jako przekazanie studentom gruntownych podstaw merytorycznych oraz zapoznanie z metodami przeprowadzania studiów teoretycznych.

Kształcenie możemy prowadzić używając dwóch programów do chemii obliczeniowej - Gaussian oraz HyperChem. Program HyperChem jest przeznaczony do modelowania molekularnego głównie w środowisku Windows i jest dostępny w wersji testowej poprzez strony producenta. Zawiera on narzędzia do budowania struktur cząsteczek, ich modyfikacji oraz obliczeń: energii, optymalizacji, oddziaływań, symulacji widm przy użyciu metod mechaniki molekularnej, metod półempirycznych oraz ab initio. Jest atrakcyjnym programem dla początkujących użytkowników. Program Gaussian to „klasyka” chemii obliczeniowej, efekt pracy kilku pokoleń teoretyków, pierwotnie skupiających się wokół Johna Popla, który w 1998 roku otrzymał wspólnie z Walterem Kohnem nagrodę Nobla za wkład w metody obliczeniowe w chemii. Jest to profesjonalne narzędzie chemii obliczeniowej, dzięki dodatkowym programom umożliwiającym przygotowanie obliczeń oraz interpretację wyników takich jak GaussView, ChemCraft, Gabedit, Molden stał się on bardzo przyjazny dla początkującego użytkownika. Prezentujemy skrypt oraz materiały dydaktyczne przeznaczone dla studentów uczących się modelowania molekularnego z wykorzystaniem wymienionych programów. Zawiera on instrukcje oraz opracowane zagadnienia z analizy struktury, parametrów spektroskopowych, mechanizmów reakcji chemicznych. Skrypt powstał podczas prowadzonych zajęć dydaktycznych na Politechnice Wrocławskiej oraz przy okazji opracowania pracy doktorskiej dotyczącej mechanizmów reakcji chemicznych oraz właściwości spektroskopowych związków fosforoorganicznych.

    NanoNet.pl jest patronem medialnym pierwszej części  skryptu, fragmenty skryptu są dostępne na stronie http://www.molnet.eu. Wersji tej nie można kopiować ani rozpowszechniać. Mile widziane są dla autorów wskazówki oraz dalsze propozycje. Można również dostać wersję w pdfie.

 więcej informacji Adres poczty elektronicznej jest chroniony przed robotami spamującymi. W przeglądarce musi być włączona obsługa JavaScript, żeby go zobaczyć.

Zakład Chemii Medycznej i Mikrobiologii Wydziału Chemicznego Politechniki Wrocławskiej Wyb. Wyspiańskiego 27; 50-370 Wrocław, Polska,

 

 


 

 

 

Referencje:

Gaussian 03, Revision C.02, M. J. Frisch, et all; Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2004; http://www.gaussian.com.
HyperChem™ Professional 7.51, Hypercube, Inc., 1115 NW 4th Street, Gainesville, Florida 32601, USA; http://www.hyper.com.
Doskocz, M.; Doskocz, J.; Gancarz, R.; Roszak, S., Modelowanie molekularne w chemii organicznej. Wrocław, 2007.

 

http://www.molnet.eu

 

Dodaj komentarz


Kod antysapmowy
Odśwież